Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DEPDC5O75140 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
DEPDC5O75140 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DEPDC5O75140 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms