Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP3O75074 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP3O75074 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP3O75074 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP3O75074 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP3O75074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP3O75074 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP3O75074 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP3O75074 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP3O75074 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP3O75074 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP3O75074 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP3O75074 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP3O75074 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP3O75074 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP3O75074 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP3O75074 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP3O75074 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP3O75074 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP3O75074 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms