Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF3O75054 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF3O75054 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF3O75054 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms