Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBNO60934 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBNO60934 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBNO60934 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBNO60934 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBNO60934 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NBNO60934 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBNO60934 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBNO60934 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBNO60934 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBNO60934 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms