Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC22O60826 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms