Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLIN1O60240 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLIN1O60240 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLIN1O60240 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms