Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNIP3LO60238 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms