Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFDO43915 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFDO43915 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFDO43915 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms