Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms