Protein–RNA interactions for Protein: O15014

ZNF609, Zinc finger protein 609, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF609O15014 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF609O15014 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF609O15014 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF609O15014 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms