Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GIPC1O14908 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIPC1O14908 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIPC1O14908 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms