Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CITO14578 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CITO14578 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CITO14578 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CITO14578 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CITO14578 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CITO14578 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CITO14578 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CITO14578 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CITO14578 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CITO14578 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CITO14578 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CITO14578 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CITO14578 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CITO14578 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CITO14578 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CITO14578 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CITO14578 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CITO14578 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CITO14578 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CITO14578 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CITO14578 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CITO14578 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CITO14578 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CITO14578 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CITO14578 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CITO14578 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CITO14578 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CITO14578 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CITO14578 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CITO14578 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CITO14578 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CITO14578 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CITO14578 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CITO14578 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CITO14578 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CITO14578 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CITO14578 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CITO14578 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms