Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DYNC1I1O14576 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1I1O14576 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms