Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP6CO00743 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP6CO00743 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP6CO00743 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP6CO00743 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP6CO00743 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP6CO00743 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP6CO00743 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP6CO00743 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP6CO00743 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms