Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN5O00501 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN5O00501 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms