Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE2AO00408 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE2AO00408 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE2AO00408 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms