Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3FO00303 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3FO00303 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms