Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPSO00116 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPSO00116 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPSO00116 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPSO00116 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPSO00116 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPSO00116 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPSO00116 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPSO00116 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPSO00116 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPSO00116 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPSO00116 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPSO00116 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPSO00116 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGPSO00116 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGPSO00116 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGPSO00116 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGPSO00116 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGPSO00116 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGPSO00116 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGPSO00116 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGPSO00116 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGPSO00116 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGPSO00116 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGPSO00116 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGPSO00116 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGPSO00116 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGPSO00116 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGPSO00116 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGPSO00116 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGPSO00116 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGPSO00116 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGPSO00116 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGPSO00116 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGPSO00116 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGPSO00116 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGPSO00116 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGPSO00116 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGPSO00116 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms