Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO7DNF2Z398 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms