Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms