Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NACAE9PAV3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NACAE9PAV3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms