Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN3E7EW58 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms