Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ERVV-2B6SEH9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVV-2B6SEH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-2B6SEH9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms