Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
B4E1Z4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B4E1Z4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
B4E1Z4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4E1Z4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4E1Z4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4E1Z4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4E1Z4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
B4E1Z4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4E1Z4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4E1Z4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4E1Z4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
B4E1Z4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4E1Z4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B4E1Z4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
B4E1Z4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4E1Z4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4E1Z4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4E1Z4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4E1Z4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
B4E1Z4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
B4E1Z4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4E1Z4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B4E1Z4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4E1Z4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
B4E1Z4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4E1Z4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4E1Z4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
B4E1Z4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
B4E1Z4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms