Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF879B4DU55 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms