Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A8MUA0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A8MUA0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A8MUA0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A8MUA0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A8MUA0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A8MUA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A8MUA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MUA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MUA0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MUA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUA0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUA0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUA0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUA0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUA0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUA0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUA0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUA0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 775.8 ms