Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFI1A8K8P3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFI1A8K8P3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFI1A8K8P3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms