Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF839A8K0R7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF839A8K0R7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF839A8K0R7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms