Protein–RNA interactions for Protein: A6NI28

ARHGAP42, Rho GTPase-activating protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP42A6NI28 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP42A6NI28 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP42A6NI28 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms