Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L4A6NEF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms