Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT2A6NDA9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms