Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP17L3A6NCW0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms