Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS37CA5D8V6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS37CA5D8V6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS37CA5D8V6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms