Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRD1A4D1F6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms