Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE3A1L190 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms