Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PQD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms