Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RRA0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RRA0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms