Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0D9SFI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A0D9SFI3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms