Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A087X0T9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X0T9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms