Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms