Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms