Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP35Q9P2H5 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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