Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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FOXQ1Q9C009 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FOXQ1Q9C009 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FOXQ1Q9C009 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXQ1Q9C009 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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FOXQ1Q9C009 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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