Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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