Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF8Q9BRL6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms