Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms