Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SGF29Q96ES7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SGF29Q96ES7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SGF29Q96ES7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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