Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms