Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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