Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP6V1FQ16864 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms